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jueves, 6 de septiembre de 2012

proyecto Encode

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Encode es un proyecto internacional cuyo objetivo es crear la base de datos del genoma humano, un catálogo en el que se exponen qué tareas tienen todos sus elementos. Su nombre es un juego de palabras a partir del acrónimo en inglés de la Enciclopedia de los Elementos del ADN.


En 2007 se publicaron los resultados preliminares del estudio piloto que analizó únicamente un 1% del genoma, y ya deparó algunas sorpresas. Ahora se completan los datos con la totalidad del genoma, accesible a bajo coste gracias a las modernas técnicas de secuenciación masiva. Entre las principales aportaciones del Encode está la de echar por tierra la idea de que los genes se encuentran dispersos en un mar ADN sin ninguna utilidad, lo que se conocía como ADN basura. Ahora se ha puesto de manifiesto que las tres cuartas partes del genoma contienen instrucciones importantes para la vida. Tanto que constituyen un gran panel de control con millones de interruptores que regulan la actividad de nuestros genes.
Alrededor del 80 % del genoma humano contiene elementos relacionados con algún tipo de función bioquímica, hasta un total de 120 funciones diferentes, lo que significa que casi todo nuestro genoma está activo en algún momento.


«Nuestro genoma sólo funciona gracias a los interruptores: millones de lugares que determinan si un gen se enciende o se apaga», explicó Birney.

«Hemos encontrado que una gran parte del genoma está implicada en controlar cuándo y dónde se producen las proteínas, más allá de simplemente fabricarlas. Es una cantidad sorprendente», añadió Birney.De hecho, según las conclusiones de ENCODE, alrededor del 80 % del genoma humano contiene elementos relacionados con algún tipo de función bioquímica, hasta un total de 120 funciones diferentes.
El proyecto corre a cargo de un consorcio internacional que aúna los esfuerzos de 442 científicos -22 de ellos españoles-, procedentes de 32 laboratorios del Reino Unido, Estados Unidos, España, Singapur, Japón y Suiza, que han llevado a cabo un total de 1.649 experimentos con 147 tipos de células.

Entre esos científicos, destaca el catalán Roderic Guigó, coordinador del programa de Bioinformática y Genómica del Centro de Regulación Genómica y profesor en la Universidad Pompeu Fabra de Barcelona, quien ha liderado el grupo de análisis de ARN de ENCODE.

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